Ireland Digital Twin

The main objective of this tool is to provide practitioners tools for monitoring seagrass meadows in bio-intertidal areas and identifying potential factors that may hinder the establishment of meadows.

Ireland Digital Twin Demonstration

Users are able to experiment with code that allows them to manipulate data through simple interfaces. This data can be used in simple interfaces to interact with the outputs of climate models. They can also perform analyses to monitor seagrass area extent using satellite imagery.

Description of service

Seagrass talks to volunteers_NUIG_Galway Aquarium_ 28 03 2023

Subject matter experts’ contextual information

Background information on motivation behind seagrass meadow restoration and identification of factors that drive variation in the success of establishing seagrass meadows.

Identification of local (i.e., Irish) and European data sources relevant to seagrass restoration.

Tool for monitoring seagrass meadows in bio-intertidal areas using remote sensing

Demonstration of how to use Sentinel-2 imagery to measure changes to NDVI for monitoring area extent of seagrass meadows (can also be used for measuring macroalgal forests or macrophytobenthos)

Tool includes filtering of images with cloud or ocean cover obscuring area of interest

Widgets allow for non-technical users to visualize outcomes of tool.

Visualization of changes to NDVI in demonstration case in a time series.

Satellite image of Ireland

Map of Posidonia oceanica distribution from the European Marine Observation and Data Network

Data visualizations and analyses

Demonstration of how to access open data sources (e.g., Copernicus) that are relevant to seagrass meadow restoration.

Time-series of sea surface height with descriptive documentation to help users visualize similar data for their region of interest.

Visualizations of data such as point sources of pollution (from EMODnet Human Activities) in interactive maps.

Model outputs and interactive visualizations

The user can interact with outputs from ocean models for geospatially explicit estimates of biogeophysical factors in widgets

Widgets allow for interaction with observations of sea surface temperature and “what-if” future climate scenarios for sea surface temperatures for the waters surrounding Ireland (forecasting).

Video capture of logging into the Blue Cloud system

Accessing the Lab and BlueCloud

If you have NOT previously accessed the virtual lab

Step 1: Go to https://blue-cloud.d4science.org/explore to see the catalogue of virtual labs.

Step 2: Find the EcologicalRestorationLab and click "Access this VRE"

Step 3: Login with your credentials, otherwise Register for a new account. If registering a new account, make the account and come back to re-follow these steps and logging in.

Step 4: Upon arriving on the landing page, click the "Go To" tab on the top right hand corner. Then click the EcologicalRestorationLab.

If you have already added the virtual lab

Using the digital twin, frequently asked questions

What is a digital twin?

There are many definitions for digital twins, which have recently become a popular tool for monitoring complex systems and processes-such as ecosystems. They are particularly of interest in the field of marine restoration as data-driven decision support tools. Here we follow de Koning and colleagues’ (https://doi.org/10.3030/101057437) definition when developing the regional digital twins in CLIMAREST. Specifically, by integrating i) subject matter expertise ii) data collected in the local area iii) historical data for contextual information about the system iv) modelling of a system v) “what-if” scenarios.

What is a virtual research environment?

The marine restoration virtual research environment (VRE) hosted by Blue-Cloud 2026 is a cloud-based environment where users can access and interact with code and services (e.g., Jupyter notebooks, Streamlit applications). In the VRE, users can use free computational power for running computationally demanding processes such as running simulations. Users-specific workspaces include storage (e.g., for users’ own datasets) where users can adapt the code provided in the VRE for applying the tools developed for each demonstration case for their own use case.

What level of technical knowledge is needed to use a virtual research environment?

Registering and using the marine restoration virtual research environment (VRE) is open to anyone, with some tools being more or less accessible to those of different technical background, depend on the user's goal. The protocol development tools are highly accessible as they are web-based applications that allow for downloading users’ answers in a pdf format. The multi-criteria area selection tool is also highly accessible in the format of an interactive online dashboard. The other tools provided in the VRE integrate interactive elements (e.g., widgets, visualizations) to allow for non-technical users to use demonstrators with Python code, which can be adapted by users for their own cases. Thus, while non-technical users may access and interact with demonstrators, coding experience will be necessary for adapting tools to new cases.

Where can I find the digital twin?

Instructional Video

Personvernerklæring

Personvernerklæringen handler om hvordan denne nettsiden samler inn og bruker informasjon om besøkende. Erklæringen inneholder informasjon du har krav på når det samles inn opplysninger fra nettstedet vårt, og generell informasjon om hvordan vi behandler personopplysninger. Juridisk eier av nettsiden er behandlingsansvarlig for virksomhetens behandling av personopplysninger. Det er frivillig for de som besøker nettsidene å oppgi personopplysninger i forbindelse med tjenester som å motta nyhetsbrev og benytte del- og tipstjenesten. Behandlingsgrunnlaget er samtykke fra den enkelte, med mindre annet er spesifisert.

1. Webanalyse og informasjonskapsler (cookies)

Som en viktig del av arbeidet med å lage et brukervennlig nettsted, ser vi på brukermønsteret til de som besøker nettstedet. For å analysere informasjonen, bruker vi analyseverktøyet Google Analytics. Google Analytics bruker informasjonskapsler/cookies (små tekstfiler som nettstedet lagrer på brukerens datamaskin), som registrerer brukernes IP-adresse, og som gir informasjon om den enkelte brukers bevegelser på nett. Eksempler på hva statistikken gir oss svar på er; hvor mange som besøker ulike sider, hvor lenge besøket varer, hvilke nettsteder brukerne kommer fra og hvilke nettlesere som benyttes. Ingen av informasjonskapslene gjør at vi kan knytte informasjon om din bruk av nettstedet til deg som enkeltperson. Informasjonen som samles inn av Google Analytics, lagres på Googles servere i USA. Mottatte opplysninger er underlagt Googles retningslinjer for personvern. En IP-adresse er definert som en personopplysning fordi den kan spores tilbake til en bestemt maskinvare og dermed til en enkeltperson. Vi bruker Google Analytics sin sporingskode som anonymiserer IP-adressen før informasjonen lagres og bearbeides av Google. Dermed kan ikke den lagrede IP-adressen brukes til å identifisere den enkelte brukeren.

2. Søk

Hvis nettsiden har søkefunksjon så lagrer informasjon om hvilke søkeord brukerne benytter i Google Analytics. Formålet med lagringen er å gjøre informasjonstilbudet vårt bedre. Bruksmønsteret for søk lagres i aggregert form. Det er bare søkeordet som lagres, og de kan ikke kobles til andre opplysninger om brukerne, slik som til IP-adressene.

3. Del/tips-tjenesten

Funksjonen "Del med andre" kan brukes til å videresende lenker til nettstedet på e-post, eller til å dele innholdet på sosiale nettsamfunn. Opplysninger om tips logges ikke hos oss, men brukes kun der og da til å legge inn tipset hos nettsamfunnet. Vi kan imidlertid ikke garantere at nettsamfunnet ikke logger disse opplysningene. Alle slike tjenester bør derfor brukes med vett. Dersom du benytter e-postfunksjonen, bruker vi bare de oppgitte e-postadressene til å sende meldingen videre uten noen form for lagring.

4. Nyhetsbrev

Nettsiden kan sende ut nyhetsbrev via epost hvis du har registrert deg for å motta dette. For at vi skal kunne sende e-post må du registrere en e-postadresse. Mailchimp er databehandler for nyhetsbrevet. E-postadressen lagres i en egen database, deles ikke med andre og slettes når du sier opp abonnementet. E-postadressen slettes også om vi får tilbakemelding om at den ikke er aktiv.

5. Påmelding, skjema

Nettsiden kan ha skjema for påmelding, kontaktskjema eller andre skjema. Disse skjemaene er tilgjengeliggjort for publikum for å utføre de oppgaver de er ment å gjøre. Påmeldingsskjema er for at besøkende kan melde seg på eller registrere seg. Kontaktskjema er for at besøkende enkelt kan sende en melding til nettsidens kontaktperson. Vi ber da om navnet på innsender og kontaktinformasjon til denne. Personopplysninger vi mottar blir ikke benyttet til andre formål enn å svare på henvendelsen. Skjema sendes som epost via Mailgun som tredjepartsløsning. Hele innsendelen blir lagret hos Mailgun i 24 timer. Mellom 24 timer og 30 dager er det kun mailheader som blir oppbevart før innsendelsen blir slettet etter 30 dager. Årsaken til denne lagringen er for å bekrefte om eposter blir sendt fra nettsiden og videresendt til riktig mottaker. Når eposten er mottatt av mottaker så er det opp til mottaker å avgjøre Databehandlingsbehovet av eposten.

6. Side- og tjenestefunksjonalitet

Det blir brukt informasjonskapsler i drift og presentasjon av data fra nettsteder. Slike informasjonskapsler kan inneholde informasjon om språkkode for språk valgt av brukeren. Det kan være informasjonskapsler med informasjon som støtter om lastbalanseringen av systemet slik at alle brukere blir sikret en best mulig opplevelse. Ved tjenester som krever innlogging eller søk kan det bli brukt informasjonskapsler som sikrer at tjenesten presenterer data til rett mottaker.

7. Hvordan håndtere informasjonskapsler i din nettleser

På www.nettvett.no kan du lese om hvordan du stiller inn nettleseren for å godta/avvise informasjonskapsler, og få tips til sikrere bruk av internett.

Ireland Digital Twin